1. La Colonia

2. La Restauración

La Compañía de Jesús fue restaurada por PioVII en 1814, pero a Centroamérica los jesuitas no volvieron hasta 1843, cuando acompañaban una expedición de belgas colonizadores que desembarcaron en la costa atlántica de Guatemala.  Una década después se funda un colegio en la capital, se asume la iglesia La Merced y se abren residencias en Quetzaltenago y Livigston, desde donde se impulsan misiones a toda la región.

Con las reformas liberales de 1871, los jesuitas fueron expulsados de Guatemala, y ante la imposibilidad de quedarse en El Salvador y Honduras, se dirigeron a Nicaragua.  Ahi, para evitar problemas con el gobierno, se dedicaron principalmente a la pastoral en el campo y la ciudad. Pero finalmente fueron acusados de colaborar en la revuelta indígena de Matagalpa, y en consecuencia, expulsados en 1881.

De ellos, un grupo se estableció en Costa Rica, pero en 1884 también se decretó su expulsión.   

Panamá era el único país con gobierno no hostil, así que un grupo de jesuitas se instaló allá, uno de ellos fue nombrado obispo, y a la orden se les encomendó el seminario, pero en 1896, el sucesor del obispo jesuita entregó sus obras a otros religiosos, con lo cual los jesuitas abandonaron el país. Este fue el fin de la segunda etapa de la Compañía en Centroamérica, para entonces unos 130 jesuitas había trabajado en la región, un tercio de ellos nacidos aquí.

3. La Provincia de Centroamérica

En 1914, tras 20 años de ausencia en Centroamérica, los jesuitas llegan a El Salvador y desde ahí se extenderán al restó de países.  23 años más tarde, en 1937, Panamá es anexada a la región y queda constituida la Viceprovincia Centroamericana, dependiente aún de la Provincia de Castilla.  A partir de entonces se sentaron las bases de la actual provincia.  Había en ese momento 178 jesuitas, más de la mitad nacidos en México, el resto de España, Italia y Francia.  Las vocaciones locales eran a penas el 10% pero en aumento a partir de la fundación del propio noviciado en San Tecla en 1949.

En 1976, el P. Arrupe elevó Centroamérica a Provincia, tres años después Honduras, que había sido misión de Missouri, fue integrada.   

4. La confirmación martirial

Impulsados por el Vaticano II, Medellin y la Congregación General XXXI, los jesuitas renovaron sus opciones apostólicas. Se actualizaron los programas de los colegios tradicionales y se abren nuevos colegios en zonas populares, lo mismo que parroquias en áreas rurales y suburbios.  Se fundaron centros sociales y las tres universidades incidían con fuerza en la vida social y política de la región.

La efervescencia apostólica fue potenciada por la CGXXXII (1974) y desembocó en el primer plan apostólico provincial en 1979.    Eran tiempos difíciles, de gobiernos militares e insurrecciones. La Compañía pronto pagó un precio por sus opciones: intimidación, deportaciones y hasta martirios.  El primero fue Rutilio Grande (1977), luego e Pérez Alonso en 1981 y finalmente la comunidad de la UCA de San Salvador en 1989.